أكد الكاتب السياسي عمار علي حسن أن السلفية الجهادية ورقة في يد مكتب أرشاد جماعة الإخوان المسلمين يستخدمها كيفما شاء ولأهداف معينة  وأوضح حسن خلال مداخلة هاتفية مع الإعلامي جمال الكشكي في برنامج "خارج الإطار" الذي يذاع على قناة "التحرير"، الجمعة 14 يونيو، أن الظواهري وأنصاره يقومون بتهديد الشعب المصري، متصورين أن هذه التهديدات سترهب الشعب المصري بعد ثورة 25 يناير . وتساءل حسن لماذا أعلنت السلفية الجهادية الوقوف بجانب مرسي يوم 30 يونيو بالرغم من عدم تطبيقه للشريعة الإسلامية موضحًا أنه كيف يمكن لأحد أن يتحدث عن الجهاد داخل مصر واستحلال الدم المصري.